В ст. 115 Устава предусмотрена ответственность грузоотправителя, грузополучателя за простой вагонов. В установленных случаях с них взыскивается штраф в сумме 0,2 минимального размера оплаты труда за каждый час простоя с каждого вагона. Частью 2 ст. 115 Устава предусмотрена аналогичная ответственность железной дороги перед грузоотправителем и грузополучателем в следующих случаях:

• за задержку подачи вагонов под погрузку и выгрузку;
• за задержку уборки вагонов с мест погрузки и выгрузки на железнодорожных подъездных путях в случае, если уборка вагонов производится локомотивом, принадлежащим организации железнодорожного транспорта;
• за задержку по вине железной дороги приема вагонов с железнодорожных подъездных путей.

Железная дорога обязана уплатить грузоотправителю, грузополучателю за каждый вагон в час, при виновном нарушении его, предусмотренных договором, связанным с эксплуатацией железнодорожного подъездного пути, или договором подачи и уборки вагонов, срока подачи вагонов под погрузку, выгрузку, срока уборки вагонов. Ответственность грузоотправителей, грузополучателей, железной дороги в случаях, предусмотренных ч. 1, 2 ст. 115 Устава, увеличивается в два раза за задержку цистерн, цементовозов, минераловозов и других специализированных вагонов и в три раза за задержку рефрижераторных вагонов и транспортеров.

В ст. 132 Устава предусмотрена ответственность при повреждении и утрате предоставленных железной дорогой вагонов, контейнеров. Субъектами ответственности являются грузоотправители, грузополучатели и другие организации участники транспортного процесса. В случае повреждения могут быть применены несколько способов защиты, предусмотренных ст. 12 ГК: восстановление положения, которое существовало до нарушения права, — ремонт поврежденных вагонов за счет лица, ответственного за принесенное повреждение, либо уплата штрафа в размере пятикратной стоимости повреждения вагонов по ценам на момент повреждения. Помимо уплаты штрафа грузоотправители, грузополучатели, другие организации возмещают убытки, понесенные железной дорогой вследствие такого повреждения, в части, не покрытой штрафом. При утрате вагонов подлежит уплате штраф и должны быть возмещены убытки в части, не покрытой штрафом. Установленный штраф подлежит взысканию в безакцептном порядке, на основании ст. 124 Устава, а убытки — путем обращения с иском в арбитражный суд.

В ст. 123 Устава предусмотрена аналогичная ответственность ст. 122 Устава, но при повреждении вагонов железной дорогой.